metodo sds-pageè usato per separare la proteina prima dell'analisi di ms. e facendo funzionare i buffer, talicome glicina o tricina, avrà un effetto sulla separazione delle proteineprocessi. sistemi di buffer di esecuzione basati su tricine sono stati applicati con successola separazione di vari tipi di proteine.
anche se tricine-dsds-pageè un potente strumento nella separazione delle proteine di membrana, williams et al. (Doi: 10.1002 / elps.200500730)ha anche esplorato altri sistemi tampone insieme all'approccio dsds-pagee descrivi un ortogonale bicina metodo -dsds-page per l'analisi della membranaproteine dal batterio anaerobico, clostridiumthermocellum . e hanno confrontato i sistemi glycine-, tricine- e bicine-dsds-page.
in primo luogo, thermocellum le colture cellulari sono state coltivate a55 ° ce raccolto. e la pagina di glicina, tricine e bicordi era usata perseparare le proteine nella prima dimensione usando il protocollo laemmli, quindiulteriore separazione nella seconda dimensione. a causa di sds-page gel e in esecuzionei tamponi sono normalmente utilizzati nell'intervallo di pH compreso tra 6,6 e 8,8, il che rende bicino- (phintervallo di 7.6-9.0) e sistemi di buffer basati su tricine (ph range di 7.4-8.8)un po 'più adatto. e secondo i risultati sperimentali del primodimensione, i parametri ottimizzati per la separazione del gel in pagina-dsds bicino e tricinesono stati ottenuti. in base ai parametri ottimizzati ottenuti, esperimenti di grande formatosono stati eseguiti per migliorare ulteriormente la rappresentazione delle proteine e aumentare le proteinecapacità di carico del gel.
nel lavoro di Williamset al., hanno trovato l'uso di sistemi tampone elettroforetici diversi dalapproccio tradizionale laemmli aumenta la risoluzione e la rappresentazione della membranaproteine. e si è constatato che la pagina a due dds ha fornito la migliore separazionecondizione di tutti.
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