Il MOPS è un composto organico con formula molecolare C ₇ H ₁₅ NO ₄ S e peso molecolare 209,26. Il MOPS è un importante tampone biologico, che viene spesso utilizzato per preparare il tampone per l'elettroforesi dell'RNA. Può essere utilizzato non solo come sistema tampone del mezzo di coltura cellulare, ma anche come tampone per elettroforesi comune e tampone per cromatografia di purificazione delle proteine. Il brevetto CN114317704B introduce un metodo e un kit per rilevare N6-metiladenina in molecole di acido nucleico. Il MOPS nel brevetto è utilizzato principalmente come componente tampone, questa settimana, l'editore YACOO ha introdotto un metodo per rilevare la metiladenina N6 nelle molecole di acido nucleico. I passaggi specifici sono i seguenti:

(1) il gruppo amminico della guanina nella molecola di acido nucleico da testare è protetto per ottenere la molecola di acido nucleico protetta;

(2) In presenza di composti carbonilici, le molecole di acido nucleico protette reagiscono con il nitrito in un solvente per convertire l'adenina nelle molecole di acido nucleico in ipoxantina. Il solvente è acqua, tampone MES, tampone acetato di sodio, tampone MOPS, tampone PIPES, tampone HEPPS, tampone TRIS o qualsiasi loro combinazione ;

(3) Facoltativamente, deproteggere il prodotto ottenuto nella fase (2);

(4) Rilevare i prodotti ottenuti nel passaggio precedente.

Il metodo dell'invenzione utilizza il nitrito per la deaminazione dell'adenina nella molecola di acido nucleico da testare e la converte in ipoxantina, mentre la metiladenina N6 non può essere deaminata a causa delle sue proprietà chimiche stabili, in modo che il rilevamento del livello di modifica dell'm6A o del sito dell'm6A possa essere realizzato analizzando il segnale di adenina o ipoxantina prima e dopo la trasformazione. Questo metodo ha un'elevata sensibilità e una quantificazione accurata e può rilevare la metiladenina N6 sull'intero genoma o sull'intero trascrittoma a livello di singola base.

Riferimento

CN114317704B Metodo e kit per la determinazione della N6-metiladenina nelle molecole di acido nucleico.